Нэйт Нунан продолжает совмещать школьную жизнь со своей тайной жизнью ниндзя, но вскоре понимает, что это не так просто, как ему казалось изначально. На юного героя обрушиваются одновременно несколько важных дел! Тайный орден ниндзя Края поручил ему новую миссию – выяснить, что же задумал доктор...